「新冠突破」30分钟不到1美元出结果,基因传感器突破新冠检测( 二 )
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机器学习与高敏感度
研究中达到的最高敏感度相当于每微升0.3拷贝 , 这足以检测唾液或其他体液中的DNA序列 。而通过应用在接触各种不同浓度的互补DNA序列的基因感应器而获得的扫描电子显微镜图像而进行的机器学习里 , 互补SARS-CoV-2序列也被诊断出了 。
“通过将机器学习算法应用于图像处理 , 我们能够高度精准地区分不同浓度的互补SARS-CoV-2 DNA序列 , ”Raymundo-Pereira 说 。
在检测实验中 , 基因传感器的敏感度在对照样本中被验证 , 对照样本包括SARS-CoV-2和其他与病毒无关的DNA生物标志物的阴性序列 。通过多维投影技术获得的数据分析表明(其技术称为交互式文档映射 (interactive document mapping, IDMAP)) , 不同浓度的互补DNA序列与对照阴性样本(即包含非互补序列的样本或其他与SARS-CoV-2无关的DNA生物标志物样本)之间 , 存在明显区别 。
因地制宜的多样性
“使用多种检测方法的优点是操作模式也能多面通用化 , 因此可以根据每个国家或像巴西这样的大陆国家的不同地区的实际情况实施诊断方法 。我们的基因传感器对检测SARS-CoV-2新型变体的基因物质 , 是很有前景的 。为此 , 如果该变体的基因序列已知 , 您只需更换 , 使用捕获探针的简单DNA条带即可 , ”Oliveira Junior 解释道 。
多学科合作
开发该设备的多学科团队包括圣保罗大学圣卡洛斯物理研究所 (IFSC-USP)、圣卡洛斯化学研究所 (IQSC-USP)、数学科学与计算研究所 (ICMC-USP)、巴西农业研究公司 (EMBRAPA) 的仪器部门 , 以及位于Curitiba, Paraná州的 Pelé Pequeno Príncipe研究所 。
原文链接:
1.https://pubs.rsc.org/en/content/articlelanding/2021/QM/D1QM00665G
2.https://medicalxpress.com/news/2021-08-biosensor-ultra-fast-cheap-sars-cov-.html
原文参考:
Juliana Coatrini Soares et al, Detection of a SARS-CoV-2 sequence with genosensors using data analysis based on information visualization and machine learning techniques, Materials Chemistry Frontiers (2021). DOI: 10.1039/D1QM00665G
注:本文旨在介绍医学研究进展 , 不能作为治疗方案参考 。如需获得健康指导 , 请至正规医院就诊 。
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第五届现代临床分子诊断研讨会
【「新冠突破」30分钟不到1美元出结果,基因传感器突破新冠检测】来源:转化医学网
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