古DNA技术如何发展?付巧妹团队称“浪里淘金”未来可期( 二 ) 本文转自：中国新闻网中新网

DNA捕获技术不仅使得对古DNA的测序效率大大提高，还能有效从一些“棘手”的样本中得到足够的数据用以分析。一个典型的例子是付巧妹团队去年发表在《细胞》杂志上的古代南方人群的基因组研究。中国南方温暖潮湿的环境和当地的酸性土壤都不利于古DNA的保存，使得这片区域的古DNA研究一度处于空白状态。利用DNA捕获技术，付巧妹团队成功获取30个古南方人群的基因组信息，从而揭示出一万余年以来东亚和东南亚交汇处的人群遗传史。
付巧妹团队透露，最近，古DNA研究人员进一步挑战极限，他们脱离化石的桎梏，直接从“土”(沉积物)里提取古DNA 。这项技术已成功应用在丹尼索瓦洞和白石崖溶洞中，成功获取数万年前的古老型人类的DNA 。
未来可期：提升效率拓展视野、着眼人类健康
付巧妹团队指出，虽然古DNA领域研究成果丰硕，但古DNA研究却一直充满艰辛和挑战。古DNA本身极易受到污染，其实验过程也极为精细，以往古DNA提取和建库几乎全程都依赖人工操作。最近，在全球少数几个实验室中，部分古DNA实验步骤成功整合到全自动移液机器人平台中，不仅极大节省人力和物力，还减少了人工操作引入污染的风险。不过，目前样品的前处理步骤仍只能依赖人工，如何把这项耗时耗力的工作整合到自动化体系中，是古DNA实验技术的需要攻克的下一道难关。
另外，古DNA技术的应用远不止于人类古基因组。通过古微生物DNA信息追溯古代疫病流行和共生微生物演化、利用古表观遗传学信息探究古代动物和环境的相互作用，以及利用古蛋白质探索更大时间尺度的人类演化等，都是古分子的重要分支方向。如何更有效地获取这些信息，并将信息进行多维度结合，将是未来研究的难点之一。
付巧妹团队表示，古DNA是带着时间刻度的遗传信息，它从独一无二的视角书写人类数万年来的演化与适应。这些岁月的痕迹不仅记录了人类的遗传历史，还在持续地影响着现今人群的生理和健康。当今人们一些重要功能基因单倍型就推测来自于已灭绝古人类，这些基因涉及到先天免疫、脂代谢、高海拔适应性、肤色、新冠重症易感性等。还有东亚人群特有的与头发和牙齿表型相关的基因型，也是在末次盛冰期(距今约2.65万-1.9万年)快结束或之后不久的时间里频率升高，推测与环境适应性相关。
然而，还有很多古DNA研究发现的特殊基因型的功能尚未确定。“在未来，可以通过构建动物模型并结合基因编辑技术对这些发现进行验证。结合古DNA技术与现代前沿分子生物学技术，我们将能更清晰地理解演化史对我们当今人类健康的影响。”付巧妹团队总结说。