世界首张小鼠“扰动图谱”揭秘基因功能!上海科技大学池天团队成果登上《细胞》( 二 )
据悉 , 研究团队构建了一个iMAP品系 , 它携带61个gRNA表达单位 , 共靶向6个功能已知的标志基因 。该品系证明了iMAP的鲁棒性 , 包括展示转基因起码能稳定传13代 。
随后构建的iMAP品系携带100个gRNA表达单位 , 靶向90个功能不甚清晰的基因 , 以此构建了一个微型扰动图谱 , 揭示了这90个基因分别在39个组织/细胞中对细胞存活、扩增、分化的影响 。
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▲微型扰动图谱 。展示100个sgRNA分别在39个组织/细胞类型中的丰度 。
不但如此 , 研究团队还证明 , 一个iMAP品系的确可以衍生出多个传统的单基因敲除品系 。
【世界首张小鼠“扰动图谱”揭秘基因功能!上海科技大学池天团队成果登上《细胞》】上海科技大学生命学院池天课题组2016级博士刘波(已毕业)、2018级博士生荆征宇、2019级博士生张校铭、2014级博士陈玉鑫(已毕业)、2015级博士毛少帅(已毕业)为本文共同第一作者 , 池天教授为唯一通讯作者 。上海科技大学为第一完成单位 。
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