pmoA+16S测序+qPCR，揭秘溶洞甲烷氧化菌的分布( 二 ) 发表论文

通过对环境因子进行随机森林分析，发现CO2和CH4浓度随均方误差值的增加而增加，表明此两个参数是总环境参数中最重要的预测因子（P

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04、微生物共存网络研究
为了进一步探究atmMOB群落以及总体细菌群落中微生物的相互作用关系，本研究通过关联网络分别分析了两个群落的微生物互作关系。结果显示， atmMOB群落和总体细菌群落的互作网络分别包含200个和924个节点，两个网络中均呈现出正相关明显大于负相关的现象，表明两者对环境干扰的响应一致。
USCγ在atmMOB网络中占主导地位，占总节点的85.50%；而在细菌网络中， Proteobacteria和Actinobacteria为主要门。进一步对每个洞穴的子网络进行分析发现，大型模块与洞穴存在一定相关性，且Latescibacteria和NC10（Methylomirabilis）仅存在于LHD子网络中，而Bacteroidetes仅存在于PLD的子网络。在总体细菌子网络中， MOB的关键分类单元Methyloceanibacter占所有节点的1.12% ，并与大量其他节点相连。USCγ与其他细菌节点紧密连接，包括Gaiella、Povalibacter、Bacillus等许多属。

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Zi（模块内连接）-Pi（模块间连接）分析结果表明，在atmMOB网络中， 21.00%和0.50%的atmMOB节点为连接节点和模块关键节点，此两种节点被认为可能是整个网络中的关键枢纽节点。其中， USCγ占所有枢纽节点的74.42% 。而在细菌网络中，连接节点占6.24% ，模块节点占0.52% 。在细菌网络的65个关键类群中， Proteobacteria和Actinobacteria是最为丰富的类群。在atmMOB和细菌网络中，关键类群的相对丰度均与CH4和CO2浓度呈正相关。

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四、研究结论
本研究通过对桂林市三个溶洞风化岩样进行pmoA和16S rRNA基因的高通量测序，并结合环境因子的测定和qPCR技术分析得出以下结论：MOB群落在地下溶洞中具有广泛分布，且溶洞为USCγ提供了比USCα更适合的生境；USCγ是atmMOB和总体细菌群落网络中的关键类群，且两种网络对环境因素的干扰具有一致响应。本研究极大地拓展了对USC在自然环境中的生态分布的认识，并强调了它们在消耗大气甲烷方面的重要性。
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来源：健康界