复旦大学、中科院团队揭示东亚面部独特性遗传进化机制

本文转自:澎湃新闻
不同群体的头面部特征具有显著差异 , 与人类的起源、迁徙及进化具有紧密的关联 。东亚与欧洲人群面部形态差异显著 , 这背后受到怎样的遗传因素影响?是否存在自然选择作用?
为了解决上述问题 , 中科院上海营养与健康研究所汪思佳研究员团队和中科院院士、复旦大学教授金力团队联合国内外科研机构对此展开深入研究 , 在迄今为止最大规模的东亚人群数据中 , 通过一套基于图像分析与计算机算法的人类头面部特征自动量化方法 , 进行了头面部表型与基因型的相关分析 。从遗传与进化的角度 , 解析了人类头面部表型差异热点规律 , 揭示了部分东亚独特面部形态的遗传作用机制 , 也定位出了造成欧亚面部差异的遗传因素 。
北京时间2022年4月7日晚 , 相关研究成果以《构成东亚和欧洲人群面部形态差异的遗传变异》(“Genetic variants underlying differences in facial morphology in East Asian and European populations”)为题发表于国际期刊《自然·遗传学》(Nature Genetics) 。
复旦大学、中科院团队揭示东亚面部独特性遗传进化机制
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该研究优化表型量化 , 解析东亚面部遗传结构 。本文图片均为复旦大学供图
解析东亚面部遗传结构
研究人员基于近10000例3D人脸图像 , 首先构建了一套结合解剖学信息的面部分割方法 。将面部区域聚合为10块主要结构 , 分别为额头、眉弓、眼睛、颞部、颧部、鼻部、面颊、嘴上、嘴下以及下颌 。这样获取的分割后面部表型能完美对应到解剖学位置 , 为后续开展遗传学解析奠定了基础 。
人类头面部形态具有很高的遗传度 , 人群间的面部差异究竟受到何种遗传机制调控?利用多变量典型相关分析 , 研究者定位了244个影响东亚群体头面部形态的遗传变异 , 证实面部特征作为典型的复杂性状由多基因共同影响 。通过与欧洲团队合作 , 进一步发现亚欧差异信号可能是功能同质 , 因频率变化而造成的 。
研究还发现头面部相关基因主要富集在胚胎发育后期调控基因的增强子中 , 参与骨骼系统发育、区域化模式调控以及组织生成等功能 。全表型组关联分析(PheWAS)则发现 , 影响面部形态的相关遗传位点也影响着体成分、体质和毛发等其他人体表型特征 。
值得一提的是 , 本研究发现 , 面部形态表型相关的位点rs6843082与房颤风险存在显著关联 , 相关位点曾被报道可能影响心源性栓塞性中风和缺血性中风 , 这提示我们——面部特征表型可能与心血管疾病的发病风险存在关联 。
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创新可视方法 , 展现欧亚面部差异特点
相较于欧洲人 , 东亚人的面颊更突出 , 眉弓、鼻部和更为平缓 。这种不同人群间面部差异的遗传机制吸引着众多学者深入探究 。
为了挖掘亚欧人群的关键面部差异的遗传基础 , 研究团队首次将多基因评分(Polygenic Score , PGS)的方法推广到复杂形状表型上 , 创新性地提出了多基因形状分析(Polygenic Shape Analysis , PSA)方法 , 为面部形态的模拟提供了可视化基础 。
研究发现欧亚不同人群的真实面部形态差异与利用PSA模拟的由遗传因素影响的欧亚特征一致性很高 , 进而定位了13个影响东亚特有面部特征相关的遗传因素 。同时 , 相关位点无论从效应还是产生时间上而言 , 都能较好地符合东亚起源/衍生的猜测 。