基因测序3——三、四代测序来势汹汹，国产化仍在布局二代测序？( 三 ) 导读【行业分析】基因测序系

GridION测序仪可安装1-5个流通池，紧凑型台式设备（尺寸：宽370毫米，高220毫米，深365毫米），集成计算功能，可灵活适用于实验室。纳米孔读取呈现给他们的DNA或RNA的长度-从短到超长（最长> 4 Mb），多达250 Gb的数据* —实时流式传输，可立即进行分析。与MinION系列相比，适合更大的基因组或项目，整个转录组（直接RNA或cDNA）或者大量样品。
PromethION 24和PromethION 48测序平台最多运行24/48个可独立寻址的大容量PromethION流通池,每个流通池可50 Gb的数据。据称可实现人类基因组测序成本低于1,000美元。适应于更大的基因组或项目、人口规模测序、高度复用的小基因组或目标区域或者整个转录组（直接RNA或cDNA）。
尽管其技术具有巨大领先优势，但目前业内多数对该公司测序平台的测序准确度方面存疑，认为MinION测序方法存在非随机的测序错误。比如MinION不能很好处理长于6个核苷酸的同聚物的测序，同时缺少碱基修饰检测的内参训练。据报道目前MinION测序仪的测序准确率在92％左右。对于类似致病菌和可变剪切的发掘，这样的测序准确率可以满足需求。但是对于临床检测，通常read准确率需要达到99.99％。因此，据称Oxford Nanopore公司正要在测序相关的化学反应和碱基识别软件方面进行优化。
2019年初，牛津纳米孔技术公司公布他们推出的PromethION 24和PromethION 48测序平台，最佳日读取数据量为7.6 Tb ，理论上最大数据量为15 Tb 。并宣布开放订购，仪器使用免费，但用户必须支付每年2万美元的服务合同费用。根据订单类型和数量，流量单元的价格从625美元到2000美元不等，每次运行的试剂成本为99美元。
全球TMT2020年2月3日讯，在获得中国公共健康专业人员的支持并与他们进行合作之后， Oxford Nanopore已经向中国发运了另外200台MinION测序仪以及相关耗材。
目前， Oxford Nanopore公司已选择在2021下半年在伦敦证券交易所IPO ，目前分析师对它的估值在40-70亿英镑之间。
国产化探索
现今，国内不少医院着手建立服务核酸检测需求的院内实验室，这部分医院接下来或考虑采购基因测序仪。据2021年有关报道，现阶段国内医院市场存量基因测序仪仅800台左右，并平均每年按照约100台的新增数量增长。根据国家卫健委统计信息中心披露数据，截至2020年3月底，全国医疗卫生机构数有100.9万个，医院有3.4万家。医疗卫生机构显然构成了基因测序仪厂商尚未开发的蓝海市场。
但相较于国外巨头的全面布局，但国内基因测序企业仍困在技术瓶颈中，整体上依赖于巨头的技术平台。基因测序产业链中，我国企业主要集中在技术门槛较低的中下游基因测序服务领域。
目前基因测序设备国产化主要有三种方式：
1) 收购国外企业并自主研发的方式，如华大基因于2013 年收购美国 Complete Genomics 公司，获取 CG 公司基因测序设备知识产权，在此基础上进行自主研发；
2) 合作开发OEM的方式，如贝瑞和康、安诺优达分别和 Illumina 合作开发的基因测序仪 NextSeq CN500、NextSeq 550AR ，达安基因和博奥生物则分别与 Thermo Fisher 合作的 DA8600、BioelectronSeq40 等。
3) 自主研发方式，如紫鑫药业同中科院合作开发的二代测序设备 BIGIS 系列产品，华因康开发的基因测序仪HYK-PSTAR-IIA ，华大智造自主研发的全新便携式基因测序系统 DNBSEQ E系列等。

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从表中可以看出，达安基因、博奥生物、贝瑞和康、安诺优达以及泛生子虽为国产医疗器械，实质却是贴牌合作开发并无核心技术。吉因加和华因康自主研发第二代测序仪，虽已取证，但在市场上并无亮眼表现。